La cuestión de Chipre hizo enfrentarse las distintas fuerzas del régimen. La propuesta sobre Chipre presentada a la comisión de la UE por el gobierno causó una vez más un enfrentamiento entre las distintas fuerzas del régimen fascista y declaración de ellos sobre su consideración del futuro de Turquía.
Tanto Y. Buyukanit, el Jefe del Estado Mayor, como A. N. Sezer, el Presidente se deben haber resentido mucho por que el gobierno ha informado la comisión de la UE, sin preguntarles a ellos, que van abrir un aeropuerto y un puerto a uso de la parte griega de Chipre; porque hicieron declaraciones una tras otra después de aprender este acontecimiento. El Jefe del Estado Mayor dijo que "ha aprendido esto por la televisión, mientras que el presidente dijo que "no le han informado ni directa ni indirectamente". Se sabe lo que pasó después. Continuaron la discusión por los medios de comunicación diciendo "no tenemos que informarles", "les hemos informado", "no, no nos han informado" etc.
El primer ministro se encontró con el Presidente y el Jefe del Estado Mayor en el Palacio de Cankaya (este es el palacio de la presidencia) para la reunión del "Comité Nacional" el 14 de diciembre del 2006, el día que el portavoz de la Presidencia De la Unión Europea anunció la propuesta de Turquía. Pero no les informó a ellos sobre esto. Esto no significaba nada más que dar el mensaje "Siendo el gobierno, nosotros determinamos la política incluso sobre los temas que tienen importancia grave para Turquía; no tenemos que preguntar sus opiniones". Y lo importante era la reacción que recibirían después de dar tal mensaje. Tanto el presidente como el Jefe del Estado Mayor no tardaron en mostrar la reacción que fue esperada por ellos. La falta de información y la reacción muestran que ya juegan con papeles abiertos. Las relaciones entre tres instituciones en la cumbre del estado han llegado casi al punto cero. La polarización entre la Presidencia y el Estado Mayor por un lado y el Primer Ministro y el Congreso por otro lado tiene el carácter de continuar profundizándose hasta la elección del nuevo presidente.
La guerra de Cankaya (el palacio del presidente) comenzó bajo el pretexto del problema de Chipre. El AKP y la TUSIAD son de la opinión que con la concesión a la UE referente a Chipre, en la cual ella insistía, una ventaja "grande" sería conquistada y el obstáculo más grande ante la integración a la UE sería eliminado. El ejército (también el presidente y el CHP ), en el frente contrario, tienen el punto de vista que Chipre es una cuestión "nacional" con importancia estratégica para Turquía y por lo tanto se oponen vigorosamente a la política del gobierno y de la TUSIAD.
Esta lucha dentro del régimen es una cierta etapa del proceso hacia las elecciones presidenciales. Ambos lados están preparándose desde ahora para estas elecciones que se realizarán en abril del 2007. El ejército, el presidente y otras fuerzas que afirman que son "los protectores de la república" consideran que un presidente de las filas del AKP sería un peligro para el futuro del régimen. En realidad, la presidencia de la república no es una institución decisiva para determinar la política de burguesía sino su valor simbólico es muy alto para los Kemalistas. Por eso, consideran la pérdida de esta institución como estabilización de los fundamentos del régimen. Y por lo tanto, se dice desde hace mucho tiempo que el Primer Ministro actual no debe ser candidato a la presidencia de la república y además, el presidente de la república, Sezer propone elecciones tempranas para impedir esto. Todos estos acontecimientos, la batalla de palabras y las amenazas reciprocas muestran que las fuerzas del régimen están concentradas en las elecciones presidenciales y que estas elecciones redefinirán el balance de fuerzas entre las fuerzas del régimen. El ejército, que se considera como responsable del futuro de Turquía, anuncia en cada oportunidad que hará una nueva "regulación fina" para enfrentar cualquier acontecimiento "contra la base del régimen" que pueda debilitarlo y que pueda distanciarlo de los mecanismos de decisión política. El ejército, que obligó a Erbakan y Ciller a renunciar del gobierno el 28 de febrero de 1996, que les amenazó diciendo que movilizarían los tanques contra ellos si no se iban y que logró lo que quería a través de esta actitud, muestra claramente que puede actuar de la misma manera hoy también. Levantar la consigna de la "república laica" y declarar casi cada asunto político como "materia nacional" son las únicas armas del ejército en esta "lucha de perros".
La polarización de las fuerzas internas del régimen es muy evidente.